FISH test je mikroskopický chromozómový test používaný pri prenatálnej a karcinómovej diagnostike karcinóm prsníka, rakovina žalúdka a u chronických lymfocytov leukémie. Test, ktorého výsledok je k dispozícii do 1 až 2 dní, dokáže zistiť hlavne chromozomálne abnormality, ktoré sú dôsledkom zmenenej sady chromozómov určitých chromozómy. Skúška sa vykonáva výhradne ako sprievodná alebo predbežná podrobná skúška analýza chromozómov, ktorých výsledky nemusia byť k dispozícii skôr ako 2 až 3 týždne po zbere buniek.
Čo je test FISH?
Pri teste, ktorého výsledok je k dispozícii do 1 až 2 dní, je možné zistiť hlavne chromozomálne abnormality, ktoré sú dôsledkom zmenenej sady chromozómy určitých chromozómov. Test FISH (fluorescenčná hybridizácia in situ) v prenatálna diagnostika umožňuje v prípade určitých prípadov vyvodiť závery o zmenenom chromozóme chromozómy. Na vykonanie FISH testu sa najmenej 50 nekultivovaných plodových buniek (plodové bunky) odobralo z plodová voda sú potrebné (asi 2 - 3 ml). Alternatívnou metódou na získanie vhodných buniek je odber choriových klkov, v ktorých sú bunky odoberané biopsia z regiónu pupočná šnúra pripútanosť. Špeciálny postup umožňuje rozlišovať jednotlivé vlákna chromozómov 13, 18, 21 a chromozómy X a Y fluorescenčnými farbami, takže akákoľvek prítomná trizómia je indikovaná prítomnosťou troch namiesto dvoch homológnych vlákien chromozómu . V žalúdku a karcinóm prsníkaje možné pomocou FISH testu skontrolovať, či má nádor viac ako dve kópie HER2 / neu gen (receptor ľudského epidermálneho rastového faktora), ktorý má následky pre typ chemoterapie. Pri chronických lymfocytoch leukémie choroba, viacnásobné analýzy testov FISH na kostná dreň a periférne krv vzorky môžu identifikovať najbežnejšie chromozomálne posuny v špecifických génoch, čo má tiež dôsledky pre terapie.
Funkcia, účinok a ciele
Chromozómy v izolovaných jadrách sa indukujú štiepením svojej dvojzávitnicovej štruktúry špeciálnym chemickým spracovaním alebo pôsobením tepla a sondy DNA špecifické pre chromozómy, každá so svojou komplementárnou sekvenciou DNA, sa pripájajú k „svojim“ špecifickým chromozómom. DNA sondy sú označené rôznymi fluorescenčnými farbami, takže je možné použiť špeciálny softvér na odlíšenie označených chromozómov od seba a ich spočítanie v automatizovanom procese. Známe sú napríklad trizómie, pri ktorých sa pre jeden chromozóm nachádzajú namiesto dvoch chromozómových vlákien tri. Sú tiež známe takzvané monozómy, v ktorých je prítomné iba jedno vlákno chromozómu X a tri alebo štyri homológne vlákna všetkých chromozómov. Najdôležitejšie chromozomálne abnormality, ktoré je možné zistiť FISH testom v prenatálnej diagnostike, sú Ullrich Turnerov syndróm (monozómia X), syndróm trojitého X (trizómia alebo polyzómia X), Klinefelterov syndróm, v ktorých je vo všetkých alebo v časti somatických buniek u chlapcov prítomný ďalší X chromozóm (XXY namiesto XY), Downov syndróm (trizómia 21), Edwardsov syndróm (trizómia 18) a Pätauov syndróm (trizómia 13). Monozómia X, v ktorej majú dievčatá iba jeden chromozóm X, je zvyčajne smrteľná, čo znamená, že asi v 98% prípadov vedie k potrat počas prvých troch mesiacov od tehotenstva. V prípade, že pôrod ešte stále nastane, majú dievčatá normálnu dĺžku života, majú priemernú inteligenciu, ale často trpia mnohými malformáciami vnútorné orgány a sú zvyčajne neplodné. Syndróm Triple X s chromozómovou súpravou XXX) postihuje iba dievčatá. Normálne tehotenstva a pôrod sú možné. Väčšinou vysoké ženy s trojitým chromozómom X môžu žiť normálne a zvyčajne nevykazujú žiadne fyzické abnormality, ale štúdium ťažkosti nie sú nezvyčajné a vyskytujú sa problémy s jemnou motorikou. Klinefelterov syndróm, ktorý môže postihovať iba chlapcov a mužov, je charakterizovaný extra chromozómom X, ktorý je prítomný vo všetkých bunkách tela alebo iba čiastočne. Medzi fyzické vlastnosti patrí nadpriemerná výška s neobvykle dlhými rukami a nohami. Klinefelterov syndróm zvyčajne vedie k zníženiu rastu semenníkov so znížením testosterón sekrécie.Downov syndróm, synonymum trizómie 21, sa zvyčajne spája s určitými fyzickými vlastnosťami a kognitívnym poškodením. Existujú rôzne formy trizómie 21, z ktorých asi 21% prípadov prevažuje takzvaná voľná trizómia 95. Trisomia 18 (Edwardsov syndróm) má za následok potrat vo väčšine prípadov je spojená s rôznymi fyzickými vlastnosťami a priemerná dĺžka života je iba niekoľko dní. Trizómia 13 (Pätauov syndróm) sa tiež vyznačuje rôznymi fyzickými vlastnosťami a abnormalitami a v mnohých prípadoch vedie k potrat or pôrod mŕtveho dieťaťa. Očakávaná dĺžka života doručených detí je iba niekoľko rokov. Cieľom prenatálneho testovania FISH je zistiť známe chromozomálne abnormality v počiatočnom štádiu, aby sa rodičom ponúkla alternatíva zákonného potrat nosiť dieťa do termínu. V prípade prsníka a pečeň rakoviny, je možné skontrolovať karcinómy na zvýšený počet HER2 / neu gen pomocou testovania FISH. Ak je pozitívna, zvyšuje sa produkcia receptorov rastových faktorov, ktoré reagujú na určité chemoterapie. Na detekciu špecifických sú k dispozícii aj testy FISH gen abnormality u chronických lymfocytov leukémie (CLL), ktoré zlepšujú zhromažďovanie účinných látok pre chemoterapie.
Riziká, vedľajšie účinky a nebezpečenstvá
Samotný test FISH nie je spojený so žiadnymi rizikami ani rizikami. Iba odber buniek, ktoré majú byť vyšetrené biopsia alebo amniocentéza sú spojené s menším rizikom infekcie z dôvodu ich invazívnej povahy. Zvláštnosťou je, že aj keď test FISH dokáže zistiť niektoré špecifické chromozomálne aberácie, nie je isté, či v prípade negatívneho výsledku nedochádza k chromozomálnym aberáciám, pretože testom FISH nie je možné zistiť všetky abnormality. V prípade pozitívneho výsledku testu by mali nasledovať ďalšie diagnostické postupy na potvrdenie alebo odmietnutie výsledku ako falošného.