ťažký magnézium nedostatok je extrémne zriedkavý. Prvým znakom nedostatku je sérum magnézium hladina pod normálnu - nazývaná hypomagneziémia (nedostatok horčíka). Postupom času sérum vápnik úroveň tiež začína klesať, aj keď PTH (paratyroidný hormón) stúpa, aby sa vyrovnala strata a napriek tomu, že sa dostatočné množstvo vápniku prijíma s jedlom. Normálne spôsobuje PTH vápnik mobilizovať z kosti na zvýšenie hladín vápnika v sére na potlačenie hypokalciémie. Ako magnézium nedostatok postupuje, klesá aj PTH spolu so sérovými hladinami draslík čím sodík sa zadržiava v tele. Známky závažnosti nedostatok horčíka zahŕňajú hypomagneziémiu (nedostatok horčíka), hypokalciémiu (vápnik nedostatok), hypokaliémie (draslík nedostatok) a nízke koncentrácie PTH v sére. Okrem toho pravdepodobne v dôsledku hypokalciémie, svalov kŕče a chvenie, strata chuti do jedla, nevoľnosť, zvracaniea dochádza k zmenám osobnosti.
