Bakteriálna cholangitída: Anatómia-fyziológia

žlč kanály spájajú žlčník (vesica fallea alebo biliaris, latinsky vesica “mechúr“A fallis alebo bilis„ žlč “) do tenké črevo, Cez žlč žlčovody syntetizované (vytvorené) v pečeň a zahustený (zahustený na asi 10% pôvodného množstva) objem; 30-80 ml žlče) v žlčníku smeruje do tenké črevo, kde slúži hlavne na trávenie tukov a vstrebávanie.V žlč potrubný systém, mechanické a chemické obranné systémy zabezpečujú, že baktérie nemôže kolonizovať a spôsobiť infekcie. Napríklad zvierač Oddi (zvierač v oblasti, kde žlčový kanál otvára sa do dvanástnik/ duodenum) uzatvára ductus choledochus (spoločný žlčovod) proti črevnému priesvitu. Trvalý tok žlče zabraňuje vzostupu („vzostupu“) z klíčky z dvanástnik (dvanástnik). Samotná žlč je sterilná. Samotná žlč alebo jej zložky (žlčové kyseliny/ žlč soli) majú antibiotický účinok. Pokiaľ žlč môže voľne prúdiť, nedochádza k patogénnej (patologickej) bakteriálnej kolonizácii žlčových ciest.