Experiment s kôrou cinchona
Osudom sa mu nakoniec stala práca prekladateľa. Pri preklade „Pojednania o Materia Medica“ z angličtiny v roku 1790 pochyboval o presnosti účinku šupky cinchona na jej použitie proti malárie. Uskutočnil prvý pokus s drogami, ktorý sa do histórie zapísal ako pokus s kôrou cinchona.
Hahnemann pozoroval patologický stav stav v sebe v opakovaných testoch, ktoré sa zdali byť podobné striedaniu horúčka (malárie). V nasledujúcich rokoch Hahnemann testoval ďalšie lieky a dospel k rovnakým pozorovaniam ako v experimente s kôrou cinchona. V priebehu rokov vyvinul takzvané „pravidlo podobnosti“ ako princíp pre správny výber vhodnej drogy.
Prvýkrát publikovaný Hahnemannom v „Hufeland Journal“ v roku 1796, sa tento rok považuje za rok narodenia homeopatie. V priebehu rokov Hahnemann zapísal svoje zistenia a v roku 1810 bol publikovaný „Organon der rationellen Heilkunde“. Je to reformná práca dômyselného samotára s cieľom nájsť lepšie spôsoby liečenia a liečby chorých ľudí.
Organon je základom homeopatie, ktorej hlavná veta sa tu objavuje po prvýkrát v celom rozsahu: Simila similibus curentur = Podobné veci sa dajú vyliečiť podobnými vecami. Termín homeopatie sa tu tiež objavuje prvýkrát. Hahnemann tiež vydal pokyny, ktoré platia dodnes o dezinfekcii pri infekčných chorobách, domácej čistote, výžive, starostlivosti o deti a vzdelávaní.
Vyjadril prekvapivé názory na príčinu cholera. Pripisoval to, dávno pred bakteriologickou érou, „najmenším živým tvorom“, ktoré sa prenášali z človeka na človeka. Ako farmaceut a chemik napísal aj „Apotheker-Lexikon“.
Po celé desaťročia to bola veľmi vyhľadávaná a veľmi využívaná referenčná práca. Hahnemann zomrel v roku 1843 vo veku 88 rokov v Paríži a až do svojej smrti pracoval ako lekár.
