Závažný nedostatok vitamínu B6 je zriedkavý.
Štúdie preukázali, že tiamín je nevyhnutný pre správny metabolizmus a funkciu vitamínu B6. Preto sú alkoholici, ktorí majú tiež nedostatok tiamínu z dôvodu nízkeho príjmu potravy, najvyššie riziko, že budú trpieť aj dôsledkami nedostatku vitamínu B6.
Niektoré štúdie dokumentujú abnormálne elektroencefalogramy (EEG) v deficite vitamínu B6. Medzi ďalšie neurologické príznaky, ktoré sa vyskytujú pri závažnom nedostatku, patrí podráždenosť, depresiaa zmätok. Medzi ďalšie príznaky patrí glositída (zápal hrdla) jazyk), vredy alebo vredy v ústaa ragády (praskliny a vredy) v kútikoch úst.
