Nevoľnosť
Aj keď základný mechanizmus zatiaľ nie je známy, nevoľnosť sa vyskytuje u niektorých pacientov, najmä na začiatku liečby Wobenzymom®. The nevoľnosť nie je zvyčajne príliš výrazný a nie je sprevádzaný zvracanie. Často však pretrváva takmer celý deň, a preto z dlhodobého hľadiska predstavuje pre postihnutých stále značnú psychickú záťaž. The nevoľnosť môžu byť liečené dimenhydrinátom (Vomex®), pretože doposiaľ neboli hlásené žiadne interakcie medzi touto účinnou látkou a prípravkom Wobenzym®. V mnohých prípadoch však nevoľnosť zmizne sama od seba po určitej dobe aklimatizácie (niekoľko týždňov).
Hnačka
U niekoľkých pacientov sa vyvinie hnačka v počiatočnej fáze liečby Wobenzymom®. Presné mechanizmy tohto spojenia zatiaľ neboli identifikované, predpokladá sa však, že: enzýmy obsiahnuté v prípravku zvyšujú črevnú aktivitu. Podľa súčasného stavu vedomostí neexistuje dôvod, prečo by pacienti nemali brať loperamid uľaviť hnačka v týchto prípadoch. Hnačky sa však aj tak často zlepšia v priebehu niekoľkých dní a často zmiznú úplne a natrvalo po jednom až dvoch týždňoch.
Alergie
Aj keď toto pozorovanie ešte nie je možné presne vysvetliť biologicky a farmakologicky, použitie Wobenzymu® vedie k zníženiu krvschopnosť zrážať sa u niektorých pacientov. Z tohto dôvodu je potrebná opatrnosť u pacientov, ktorí už pravidelne užívajú antikoagulanciá (napr. Marcumar) alebo antiagreganciá (napr. ASA alebo klopidogrel). V týchto prípadoch je potrebné začať s čo najmenšou dávkou Wobenzymu®, pokiaľ je to možné, a pravidelne kontrolovať koagulačné parametre v prvých dňoch a týždňoch liečby, aby sa zabránilo krvácaniu.
Zmena stavu stolice
Pravdepodobne najčastejšie pozorovaným vedľajším účinkom liečby Wobenzymom® je zmena zloženia stolice. Výkaly postihnutých osôb sú často mäkšie a bledšie a sťažujú sa tiež na neobvykle časté vyprázdňovanie. Aj keď druhý aspekt je možné zvyčajne zmierniť antidiarrheálnymi liekmi (napr loperamid), tieto nemenia neobvyklú stolicu stav. Zvyčajne je preto potrebné iba zvážiť neškodnosť týchto zmien a počkať prvých pár dní a týždňov, pretože stolica sa po tomto období zvyčajne sama vráti do normálu.
