Nasledujú najdôležitejšie choroby alebo komplikácie, ku ktorým môžu prispieť infekcie vírusom Coxsackie:
Endokrinné, výživové a metabolické choroby (E00 - E90).
- Diabetes mellitus typu 1
- Tyreoiditída (zápal štítnej žľazy)
Koža a podkožie (L00 - L99)
- Získaná onychodystrofia (patologický rast nechtov) oboch nechtov na nohách s onychomadézou (proximálne oddelenie nechtovej platničky od nechtového lôžka) a leukonychiou (biele škvrny na nechtoch) sekundárne po chorobe slintačky a krívačky spojenej s liekom Coxsackie A6 (neskorá komplikácia) )
Kardiovaskulárny systém (I00-I99).
- myokarditída (zápal srdce sval).
- Perikarditída (zápal osrdcovníka)
Psychika - nervový systém (F00-F99; G00-G99)
- Zápal mozgových blán (meningitída).
- Meningoencefalitída (kombinované zápal mozgu (encefalitída) a meninges (zápal mozgových blán)).
- paralýza