Izoflavonoidy majú molekulárnu štruktúru podobnú steroidnému estrogénu (ženský pohlavný hormón), a preto sa tiež nazývajú fytoestrogény. Ich hormonálna aktivita je však v porovnaní s estrogénom tvoreným v organizme cicavcov nižšia o faktor 100 až 1,000 XNUMX. Vzhľadom na ich chemicko-štrukturálnu podobnosť s ženským pohlavím hormóny, izoflavóny požité s jedlom sa môžu viazať na takzvaný estrogénový receptor typu 2 a blokovať ich pre endogénny estrogén. V súlade s tým izoflavóny u postmenopauzálnych žien s nízkou hladinou endogénneho estrogénu vykazujú estrogénnejší účinok, zatiaľ čo izoflavóny u žien pred menopauzou majú antiestrogénny účinok blokovaním estrogénových receptorov.
