Nasledujú najdôležitejšie choroby alebo komplikácie, ku ktorým môže Whippleova choroba prispieť:
Oči a očné prívesky (H00 - H59).
Kardiovaskulárny systém (I00 - I99)
- endokarditída (zápal endokardu; druhá najbežnejšia lokalizácia).
- myokarditída (zápal srdce sval).
- pericarditis (zápal osrdcovník) s chlopňovou nedostatočnosťou.
Muskuloskeletálny systém a spojivové tkanivo (M00 - M99).
- polyartritída (zápal viacerých kĺby).
- Synovialitída (zápal synoviálnej membrány)
Psychika - nervový systém (F00-F99; G00-G99)
- Amnézia (strata pamäti)
- Ataxia (porucha chôdze)
- Ochrnutie pohľadu
- demencie
- Epilepsia (záchvaty)
- Narušený rytmus spánku a bdenia
Príznaky a abnormálne klinické a laboratórne nálezy inde neklasifikované (R00 - R99).
- zápal pohrudnice (zápal pohrudnice).
