Klinicky sa rozlišuje medzi ľavým a pravým bočným lalokom, ktoré sú oddelené stredným („stredným“) žliabkom (latinsky: centrálna brázda), ktorý je možné nahmatať rektálne („cez konečník“) A stredný lalok, ktorý tvorí zadnú stenu takpovediac prostaty močová trubica (časť močovej trubice, ktorá prechádza cez prostaty) a často siaha do mechúr in benígna hyperplázia prostaty (BPH; benígne zväčšenie prostaty).
Z patofyziologického hľadiska sa dnes bežne používa klasifikácia podľa Mc Neala. Tu sa rozlišuje medzi:
- Periférne pásmo (65% prostaty objem) → posterolaterálne („zadné laterálne“) a periférne od základne (v blízkosti mechúr) prostaty k vrcholu (blízko panvové dno).
- Centrálna zóna (25% prostaty objem) → posterolaterálne k spodnej časti prostaty.
- Prechodná zóna (5-10% prostaty objem) → na oboch stranách prostaty močová trubica.
Benígna hyperplázia prostaty sa vyvíja v prechodovej zóne. Ako rastie, naťahuje periférnu zónu a tlačí ju smerom von.
Väčšina karcinómov (asi 70%) vzniká v periférnej zóne.
Na oboch stranách prostaty, dorzolaterálne („smerom dozadu“), ležia dva neurovaskulárne zväzky (nervovo-cievne zväzky). V nich bežať nervy a krv plavidlá pre kavernózne telieska penisu sú nevyhnutné pre udržanie prirodzenej erekcie. Ich prerušenie v priebehu a radikálna prostatektómia (chirurgické odstránenie celej prostaty s puzdrom, susedných semenných vezikúl a lokálneho lymfa uzly) vedie prakticky k 100% k strate erekcie.
S novšími chirurgickými metódami možno neurovaskulárne zväzky, a tým aj potenciu, zachovať aspoň u niektorých pacientov.
