Diagnóza a radikulárna cysta sa zvyčajne robí iba na základe anamnézy a klinických vyšetrení a iba röntgenových snímok.
Radikálne cysty od koreňových granulómov možno rozlíšiť až do veľkosti približne 0.5 cm iba podľa histológia (vyšetrenie jemného tkaniva).
Na potvrdenie predbežnej diagnózy v prípade neistoty v diagnostike alebo ťažko liečiteľnej radikulárnej cysty - laboratórne parametre 2. rádu:
- histológia
- Cystové mechy zložené z troch vrstiev
- Vnútorná výstelka dvoj- až trojvrstvového, nekeratinizujúceho plochého epitelu
- Subepiteliálna zóna zápalového infiltrátu.
- Kapsula spojivového tkaniva bohatá na kolagénové vlákna
- Lumen cysty je obvykle jednokomorový
- Cystové mechy zložené z troch vrstiev