Z dôvodu jednoznačnej klinickej diagnózy a mierneho priebehu laboratórna diagnostika vo väčšine prípadov nie sú potrebné.
Laboratórne parametre 1. rádu - povinné laboratórne skúšky.
- Detekcia vírusu pomocou enterovírusovej PCR (5′-NCR) zo vzoriek stolice, výterov z hrdla alebo z obsahu vezikúl: Zo stolice je detekcia patogénov úspešná počas prvých 1–2 týždňov choroby asi v 80% prípadov.
- Ak je to potrebné, ďalšia diagnostika pre molekulárnu typizáciu: PCR v oblasti kódujúcej proteín VP1 s následným sekvenovaním.
Laboratórne parametre 2. rádu - v závislosti od výsledkov histórie, fyzické vyšetrenieatď. - na objasnenie diferenciálnej diagnostiky.
- CSF pichnutie (odber mozgovomiechového moku prepichnutím miechový kanál) na diagnostiku CSF - v symptomatológii CNS.